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Identificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricos

dc.rights.licenseAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)spa
dc.contributor.advisorRodas Mendoza, Elkin Fernando
dc.contributor.advisorChaves Bedoya, Giovanni
dc.contributor.authorSuárez Acevedo, Sara Coromoto
dc.date.accessioned2024-06-13T20:44:51Z
dc.date.available2024-06-13T20:44:51Z
dc.date.issued2021
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/7664
dc.description.abstractXanthomonas citri subsp. citri (Xac) es la causante de la cancrosis de los cítricos, enfermedad que afecta a los cultivos del género Citrus de importancia económica. La naranja Pera Río (Citrus sinensis) es moderadamente tolerante a la enfermedad, mientras que el limón galego (Citrus aurantifolia) es altamente susceptible. Para comprender mejor los mecanismos moleculares que subyacen en las diferentes respuestas de Xac, su perfil transcriptómico infectando ambos genotipos fue comparado usando RNA-Seq. 839 y 982 genes diferencialmente expresados (GDE) fueron identificados en Xac durante su interacción con la naranja y el limón, respectivamente. De estos, 607 fueron comunes en ambos genotipos. La anotación de los GDE reveló que Xac induce genes del sistema de secreción tipo III y efectores, enzimas degradadoras de paredes celulares, respuesta a estrés oxidativo, síntesis de goma Xantano, entre otros, en ambos hospederos. Asimismo, análisis demostraron que mutantes de los genes inducidos hrpX, mltB, ugd y una proteína hipotética (XAC_RS01780), relacionada con un regulador transcripcional, presentaron una significativa reducción de los síntomas de la enfermedad, sugiriendo su relevancia en el proceso infeccioso de Xac. Este estudio brindó información sobre el ambiente intercelular de Xac y las posibles estrategias utilizadas por la bacteria para desarrollar la enfermedad.spa
dc.description.tableofcontentsIntroducción 1. Objetivos 1.1 Objetivos General 1.2 Objetivos Específicos 2. Estado del Arte 2.1 El género Xanthomonas. 2.2 Xanthomonas citri subsp. citri. 2.3 Cancrosis de los Cítricos 2.4 Interacción Planta-Patógeno 2.5 Análisis Transcripcionales 3. Materiales y Métodos 3.1 Bases de Datos Transcriptómicos de Xac in vivo. 3.2 Análisis de los Genes Diferencialmente Expresados (GDE) 3.3 Validación del Transcriptoma por qRT-PCR. 3.4 Anotación Funcional de Genes y Enriquecimiento de Vías Metabólicas 3.5 Diseño del Modelo Representativo del Proceso Infeccioso de Xac 24 hdi. 3.6 Validación Funcional de Algunos Genes Inducidos 3.7 Medición de Peróxido de Hidrógeno en Planta 3.8 Modelamiento de la Proteína XAC_RS01780 4. Resultados 11 15 15 15 16 16 18 20 23 25 27 27 27 28 29 29 29 30 30 32 4.1 El transcriptoma Global de Xac in vivo Direcciona la Identificación de GDE Involucrados en el Desarrollo de la Cancrosis de los Cítricos 4.2 Genes Diferencialmente Expresados en Xac Revelan Indicios sobre su Adaptación en el Apoplasto y sus Principales Mecanismos de Patogenicidad en el Estadio Inicial de la Enfermedad 4.3 Sistema de Secreción Tipo 3 y Efectores 4.4 Genes de Xac Inducidos Específicamente en los Hospederos Cítricos Estudiados 4.5 Diferencias Transcripcionales en Genes de Xac Asociados a Respuesta a Estrés Oxidativo en los Genotipos Estudiados 4.6 Descripción General del Mecanismo de Adaptación de Xac al Interior de los Genotipos Estudiados 4.7 Validación Funcional de los Genes Inducidos de Xac. 4.8 La Proteína Hipotética XAC_RS01780 es un Posible Regulador Transcripcional Asociado a la Familia MarR/DUF24 5. Discusión 6. Conclusiones Referencias Bibliográficas Anexos 32 34 39 40 43 45 46 47 53 64 65 90
dc.formatapplication/pdf
dc.format.extent138 páginas. ilustraciones. 2.929 KB
dc.publisherUniversidad Francisco de Paula Santanderspa
dc.rightsDerechos Reservados - Universidad Francisco de Paula Santander, 2021spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.sourcehttps://catalogobiblioteca.ufps.edu.co/descargas/tesis/2400008.pdf
dc.titleIdentificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricosspa
dc.typeTrabajo de grado - Maestría
dc.description.notesArchivo Medios Electrónicosspa
dc.description.degreelevelMaestría
dc.description.degreenameMagíster en Ciencias Biológicasspa
dc.identifier.instnameinstname:Universidad Francisco de Paula Santander
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Digital UFPS
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.ufps.edu.co/
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias Básicasspa
dc.publisher.placeSan José de Cúcutaspa
dc.publisher.programMaestría en Ciencias Biológicasspa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subject.lembCancrosis de los cítricosspa
dc.subject.lembInteracción planta-patógenospa
dc.subject.lembTranscriptomaspa
dc.subject.lembGenes diferencialmente expresadosspa
dc.subject.proposalCancrosis de los cítricosspa
dc.subject.proposalInteracción plantaspa
dc.subject.proposalTranscriptomaspa
dc.subject.proposalGenes diferencialmente expresadosspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.contentText
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/mastherThesis
dc.type.redcolhttp://purl.org/redcol/resource_type/TM
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.identifier.signaturePMCB V00001/2021spa
dc.contributor.juryLópez Barrera, German Luciano
dc.contributor.juryMeza Osorio, Hernando Augusto
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2


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