| dc.contributor.author | Rodríguez Araujo, Edgar Alfonso | |
| dc.date.accessioned | 2022-12-16T20:56:28Z | |
| dc.date.available | 2022-12-16T20:56:28Z | |
| dc.date.issued | 2022 | |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/6672 | |
| dc.description.abstract | Este proyecto pretende evaluar el efecto de las algas sobre el cultivo de arroz (Oryza
sativa, L) en Cúcuta, Norte de Santander, a través de la identificación del alga presente
en las plantaciones de arroz (Oryza sativa, L) en el corregimiento de Buena Esperanza
en las veradas Florida Blanca y Londres, municipio de San José de Cúcuta por medio de
secuenciación - reacción en cadena de la polimerasa (PCR), y de esta forma determinar
los métodos de manejo químico, manejo físico y manejo biológico del alga en este
sistema de producción, además de evaluar los componentes de rendimientos de arroz
cosechado con presencia de algas versus lotes no afectados. La investigación surge de
la necesidad de buscar solución a la problemática existente en los arrozales, ya que las
algas encuentran condiciones óptimas para su crecimiento en los cultivos de arroz, lo
que impide el buen desarrollo del cultivo. Las algas alcanzan un desarrollo tal, que son
capaces de competir con el cultivo del arroz, obstruyendo el paso de la luz y creciendo
hasta el punto de impedir físicamente que el arroz emerja de la lámina de agua, lo que
acaba por provocar una elevada tasa de mortalidad entre las plantas. Las algas tambien
impiden la germinación y crecimiento de los cultivos de arroz, ya que cubre gran
extensión de suelo y al aplicar un herbicida no permite su paso al suelo para el control o
manejo de malezas, lo cual conlleva a una baja en la producción. En Norte de Santander
no se ha identificado el alga que está generando este inconveniente, de igual forma se
desconoce el manejo (químico, físico y biológico) que se le debe dar para mitigar esta
problemática y mucho menos se han realizado evaluaciones de los componentes del
rendimiento en arroz cosechado con resencia o ausencia del al a. | spa |
| dc.format.mimetype | application/pdf | spa |
| dc.language.iso | spa | spa |
| dc.title | Efectos de las algas sobre el cultivo de arroz (oryza sativa, l) en el distrito de riegos, Norte de Santander | spa |
| dc.type | Propuesta de investigación | spa |
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| dc.contributor.researchgroup | GICAP | spa |
| dc.coverage.projectdates | 2022-09-17/2023-09-17 | spa |
| dc.description.methods | Localización
Este estudio se llevará a cabo en el departamento de Norte de Santander (Coordenadas:
7°54'N 72º30'0) principalmente en los municipio de San José de Cúcuta (Coordenadas ·
7°54'27" N 72º30'17"0) y El Zulia (Coordenadas 7°55'57"N 72º36'09"0) en sus áreas
rurales, en las áreas de producción del cultivo de Arroz (Oryza sativa). La selección de
los puntos de muestreo se realizará teniendo en cuenta las zonas de mayor
representatividad dentro de las parcelas, en ese sitio, se evaluaran las propiedades
químicas, físicas y biológicas del suelo
Solo se tendrán en cuenta lotes que estén bajo la asesoría de la unidad técnica de la
empresa Coagronorte.
Descripción de los tratamientos
Se escogerán quince (15) puntos de muestreo, donde se tomaran las muestras de algas
y se evaluaran las propiedades químicas, físicas y biológicas del suelo distribuidos
estratégicamente en los municipios de San José de Cúcuta y El Zulia.
Des ués de la recolección de las al as se realizará el aislamiento de ce as de microalgas, se caracterizará morfológicamente, se aislará el ADN, se cuantificará, se
amplificará los genes ITS, se realizará electroforesis y se realizará la secuenciación:
Para abordar el objetivo número uno del proyecto se plantea la siguiente metodología
Aislamiento de cepas de Microalgas: Las cepas de Microalgas serán aisladas de
cultivos de arroz, tomando con una espátula estéril una muestra del tapete donde se
observa crecimiento de algas. Las muestras serán transportadas en una cava con
refrigeración hasta el laboratorio y se sembrarán bajo condiciones de temperatura de 26
± 2ºC a luz continua (120 μm2s-1) bajo un fotoperiodo de 12:12 (luz: oscuridad) en un
medio de cultivo BG11 acoplado a un pH9. Para su fase de crecimiento se implementa
un volumen total de trabajo del reactor del 60% siendo alimentado por un flujo de aire
previamente filtrado de 0.6 wm (volumen de aire/volumen de medio/por minuto). Cada
20 días se re-inocularon las cepas en cajas Petri, medio líquido para finalmente proceder
con la extracción del material genético.
Caracterización morfológica: Se procederá a la caracterización morfológica buscando
formas coloniales, unicelulares y filamentosas (Pineda R., 2011) Se tendrán en cuenta
las claves morfológicas propuestas (Tejera, 2021),
Aislamiento de ADN y cuantificación: Se usará el protocolo descrito mediante el kit
lnvisorb® spin Universal Kit de la casa comercial Vertex technics. Para la cuantificación
se hará uso del equipo de espectrofotometría NanoDrop con el fin de evaluar la
concentración de los ácidos nucleicos a 260nm y su pureza a una relación A260/280 y
A260/230. El proceso a realizar implica levantar el pedestal, adicionar 2 micro litros de
muestra, cerrar el pedestal e iniciar con el proceso de cuantificación (BancoDNA, 2020)
Amplificación de genes ITS: Los cebadores que se utilizarán serán el ITS1 , ITS4, NS7
y NS8 el volumen esperado es de 20 microlitros, el volumen del mix dependerá del
número de muestras a realizar. En un termociclador se programará: aplicando 5 minutos
de denaturación inicial a 94ºC, seguido de 30 ciclos de 30 segundos de denaturación a
94°C, 30 segundos de hibridación de los primers a 55ºC, y una extensión de 30
segundos a 72ºC. La PCR culminará con una extensión final a 72ºC durante 1 O minutos
(Carrillo Jovel V., 2019).
Electroforesis: Se realizará la visualización por medio de la electroforesis de las
diferentes amplificaciones en un gel de agarosa al 2% en buffer TBE 1 X en una cámara
de electroforesis horizontal. Con el revelador GelRed® y como marcador molecular
Generales de 1 kb de (Therm Fisher Scientific lnc., USA). El gel se observará en un
equipo para análisis y documentación en el transiluminador Chemidoc® (Muñoz Morales,
2021).
Secuenciación: Después de realizar la caracterización morfológica y determinar la
amplificación de los genes, se procederá a enviar al Macrogen las muestras
correspondientes a un proceso de secuenciación por Sanger para la confirmación de
Qénero y especie. Posteriormente, se hará uso de las herramientas bioinformáticas para depurar las secuencias y realizar el ensamble hasta obtener el código, para esto se
usará el paquete de DNASTAR-lasergene. Una vez obtenidas las secuencias se
procederá a comparar con las secuencias reportadas en el NCBI utilizando BLAST,
seguidamente un análisis de secuencias con el programa MEGA y por último, la
construcción del árbol filogenético.
Para desarrollar el objetivo dos, se plantea la siguiente metodología:
En los muestreos de suelos: propiedades físicas, químicas y biológicas del suelo. La
selección de los puntos de muestreo se realizara teniendo en cuenta las zonas de mayor
representatividad dentro de las parcelas, en ese sitio, se tomaran las muestras de suelo
a la profundidad de O - 30 cm.
Para el muestreo químico se tomaran las muestras de suelo en bolsas plásticas
(aproximadamente un kilo de suelo) y trasladadas al laboratorio de suelos de la
Universidad Francisco de Paula Santander donde se procederá a realizar su análisis.
En la tabla 1. Se presenta la metodología para la determinación de las propiedades
químicas de suelos.
En cada uno de los puntos donde se tomaran las muestras descritas anteriormente (O -
30 cm}, Se tomaran muestras de suelo disturbado y sin disturbar, además de medidas
directas con la ayuda equipos que se trasladaran a los puntos de muestreo para
determinar las propiedades físicas del suelo. En la tabla 2. Se presentará la metodología
para la determinación de las propiedades físicas de suelos.
Para lel muestreo de las propiedades biologicas del suelo se realizara siguiendo la
metodología del Tropical Soil Biology and Fertility Programe (TSBF) (Anderson & lngram
1993), que se basa en la captura y recolección de organismos del suelo, (visibles al ojo
humano), para determinar presencia y densidad de población en un volumen de suelo
conocido. La técnica consiste en hacer un "monolito", con ayuda de un marco metálico
de 25 cm. de largo por 25 cm. de ancho y 1 O cm. de profundidad en los tres puntos
asociados a las repeticiones.
El protocolo, validado en el marco del proyecto ADEME Bioindicateurs de Francia, Ruiz
et al., 2008 implica que luego de enterrar el marco, éste, se retira con todo el suelo
contenido para luego empacarlo en costales previamente rotulados para su posterior
separación de individuos.
Después de recolectadas las muestras, se realizará una separación detallada de todos
los invertebrados del suelo visibles a simple vista. Las lombrices se depositaran en
recipientes con formol al 4% para su posterior identificación y clasificación, los demás
insectos se depositaron en alcohol etilico al 70%. Cada uno de los frascos estaran
rotulados con los datos del punto donde fueron colectados.
La metodología TSBF (Anderson & lngram 1993) se basa en la cuantificación de
densidad de población, (individuos m·2), biomasa (gramos.m2) y la distribución vertical de
las poblaciones por estratos, además de agrupar a los invertebrados en unidades
taxonómicas (binomio), a nivel de clase, orden, familia y especie.
Descripción de la unidad experimental
La unidad experimental será cada uno de la muestras de algas (15 en total) y muestras
de suelos donde se evaluaran las propiedades químicas (15 en total), físicas (15 en total)
y biológicas (15 en total) del suelo, para un total de 60 muestras.
Análisis estadístico de la información
Los resultados obtenidos se les realizará análisis de componentes principales (PCA),
asociado a análisis discriminante, y test de monte Cario el cual permite describir los
patrones globales observados entre los sistemas y verificar la significancia de las
diferencias; el análisis de co - inercia permitirá analizar la covariación entre tablas de los
diferentes datos.
El análisis estadístico se realizará con la versión de software R 2.13.2 con la librería ade
-4.
Fuentes de financiación y apoyo científico
El proyecto se llevará a cabo mediante un esfuerzo colaborativo entre la Universidad
Francisco de Paula Santander y la Cooperativa Agropecuaria del Norte de Santander -
COAGRONORTE, además de acompañamiento y colaboración de la unidad técnica de
esta misma institución, tanto en la fase de campo y laboratorio. Financiado por el fondo
de investigaciones universitarias (FINU) de la Universidad Francisco de Paula
Santander. | spa |
| dc.description.researcharea | Uso v manejo de suelos degradados de Norte de Santander | spa |
| dc.rights.accessrights | info:eu-repo/semantics/closedAccess | spa |
| dc.type.coar | http://purl.org/coar/resource_type/c_baaf | spa |
| dc.type.content | Text | spa |
| dc.type.driver | info:eu-repo/semantics/workingPaper | spa |
| dc.type.redcol | https://purl.org/redcol/resource_type/WP | spa |
| oaire.accessrights | http://purl.org/coar/access_right/c_14cb | spa |
| oaire.awardcost | 25000000 | spa |
| oaire.awardnumber | 021-2022 | spa |
| oaire.awardtitle | Efectos de las algas sobre el cultivo de arroz (oryza sativa, l) en el distrito de riegos, Norte de Santander | spa |
| oaire.awardtotalcost | 60000000 | spa |
| oaire.fundingstream | Programa Nacional en Ciencias Agropecuarias | spa |
| oaire.version | http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce | spa |
| dc.type.version | info:eu-repo/semantics/draft | spa |
