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dc.contributor.advisorRodas Mendoza, Elkin Fernando
dc.contributor.advisorChaves Bedoya, Giovanni
dc.contributor.authorSuarez Acevedo, Sara Coromoto
dc.date.accessioned2021-12-02T18:37:43Z
dc.date.available2021-12-02T18:37:43Z
dc.date.issued2021
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/1661
dc.description.abstractXanthomonas citri subsp. citri (Xac) es la causante de la cancrosis de los cítricos, enfermedad que afecta a los cultivos del género Citrus de importancia económica. La naranja Pera Río (Citrus sinensis) es moderadamente tolerante a la enfermedad, mientras que el limón galego (Citrus aurantifolia) es altamente susceptible. Para comprender mejor los mecanismos moleculares que subyacen en las diferentes respuestas de Xac, su perfil transcriptómico infectando ambos genotipos fue comparado usando RNA-Seq. 839 y 982 genes diferencialmente expresados (GDE) fueron identificados en Xac durante su interacción con la naranja y el limón, respectivamente. De estos, 607 fueron comunes en ambos genotipos. La anotación de los GDE reveló que Xac induce genes del sistema de secreción tipo III y efectores, enzimas degradadoras de paredes celulares, respuesta a estrés oxidativo, síntesis de goma Xantano, entre otros, en ambos hospederos. Asimismo, análisis demostraron que mutantes de los genes inducidos hrpX, mltB, ugd y una proteína hipotética (XAC_RS01780), relacionada con un regulador transcripcional, presentaron una significativa reducción de los síntomas de la enfermedad, sugiriendo su relevancia en el proceso infeccioso de Xac. Este estudio brindó información sobre el ambiente intercelular de Xac y las posibles estrategias utilizadas por la bacteria para desarrollar la enfermedad.spa
dc.description.tableofcontentsIntroducción 11 1. Objetivos 15 1.1 Objetivos General 15 1.2 Objetivos Específicos 15 2. Estado del Arte 16 2.1 El género Xanthomonas. 16 2.2 Xanthomonas citri subsp. citri. 18 2.3 Cancrosis de los Cítricos 20 2.4 Interacción Planta-Patógeno 23 2.5 Análisis Transcripcionales 25 3. Materiales y Métodos 27 3.1 Bases de Datos Transcriptómicos de Xac in vivo. 27 3.2 Análisis de los Genes Diferencialmente Expresados (GDE) 27 3.3 Validación del Transcriptoma por qRT-PCR. 28 3.4 Anotación Funcional de Genes y Enriquecimiento de Vías Metabólicas 29 3.5 Diseño del Modelo Representativo del Proceso Infeccioso de Xac 24 hdi. 29 3.6 Validación Funcional de Algunos Genes Inducidos 29 3.7 Medición de Peróxido de Hidrógeno en Planta 30 3.8 Modelamiento de la Proteína XAC_RS01780 30 4. Resultados 32 4.1 El transcriptoma Global de Xac in vivo Direcciona la Identificación de GDE Involucrados en el Desarrollo de la Cancrosis de los Cítricos 32 4.2 Genes Diferencialmente Expresados en Xac Revelan Indicios sobre su Adaptación en el Apoplasto y sus Principales Mecanismos de Patogenicidad en el Estadio Inicial de la Enfermedad 34 4.3 Sistema de Secreción Tipo 3 y Efectores 39 4.4 Genes de Xac Inducidos Específicamente en los Hospederos Cítricos Estudiados 40 4.5 Diferencias Transcripcionales en Genes de Xac Asociados a Respuesta a Estrés Oxidativo en los Genotipos Estudiados 43 4.6 Descripción General del Mecanismo de Adaptación de Xac al Interior de los Genotipos Estudiados 45 4.7 Validación Funcional de los Genes Inducidos de Xac. 46 4.8 La Proteína Hipotética XAC_RS01780 es un Posible Regulador Transcripcional Asociado a la Familia MarR/DUF24 47 5. Discusión 53 6. Conclusiones 64 Referencias Bibliográficas 65 Anexos 90spa
dc.format.extent138 paginas. ilustraciones. 2.929 KB.spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.language.isospaspa
dc.publisherUniversidad Francisco de Paula Santanderspa
dc.titleIdentificación de genes de patogenicidad en xanthomonas citri subsp. citri mediante análisis transcripcionales en genotipos tolerantes y susceptibles a la cancrosis de los cítricosspa
dc.typeTrabajo de grado - Maestríaspa
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameMagíster en Ciencias Biológicasspa
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias Básicasspa
dc.publisher.placeSan José de Cúcutaspa
dc.publisher.programMaestría en Ciencias Biológicasspa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/closedAccessspa
dc.subject.lembCancrosis de los cítricos
dc.subject.lembInteracción planta -- Plantas
dc.subject.lembTranscriptoma
dc.subject.lembGenes diferencialmente expresados
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccspa
dc.type.contentTextspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/masterThesisspa
dc.type.redcolhttps://purl.org/redcol/resource_type/TMspa
oaire.accessrightshttp://purl.org/coar/access_right/c_14cbspa
oaire.versionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/submittedVersionspa
dc.contributor.juryLópez Barrera, German Luciano
dc.contributor.juryMeza Osorio, Hernando Augusto


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